深空之眼挑战任务的主入口在游戏主界面右下角的前往作战板块，切换到挑战标签页即可进入，部分主线关卡的挑战模式，需要在关卡编队界面左下角开启挑战开关。
完成前期主线推进，管理员等级达到对应门槛后，挑战标签页就会正式解锁，页面内集合黑区净化、梦境再构、多维变量、历战轮回等各类常驻挑战副本，不同副本会按照管理员等级逐步开放更高难度档位。很多玩家容易混淆挑战任务和主线关卡挑战模式，主线关卡的挑战模式并非独立副本入口，选定支持挑战模式的关卡，在编队界面左下角点选挑战开关，就会触发额外通关条件，完成之后可以拿到体力卡这类一次性奖励，这类关卡会在关卡预览界面用特殊标记提示，没有标记的普通主线关卡无法开启挑战模式。
常驻挑战副本大多带有周期性任务，黑区净化会刷新两次，需要搭配两队阵容进行攻坚，产出刻印重构、角色跃迁的关键材料，是每周优先级很高的挑战内容。梦境再构属于周更挑战玩法，会锁定已经出战过的角色，需要准备多套可用队伍，通关积攒的代币可以在商店兑换角色情报、高级赋能模块等实用养成物资，难度档位会随着管理员等级提升不断开放，想要拿满全部奖励，需要尽量达成关卡内的时间、存活等附加条件来收集星级点数。多维变量属于肉鸽类型的挑战，通关途中拾取随机增益buff，完成对应维度曲线任务能够拿到移转之辉，中途只选择buff不打完首场战斗不会结算任务进度，这点在刷任务的时候需要多加留意。历战轮回为一次性挑战关卡，每一小节通关之后直接获取奖励，主要用来积累抽卡资源，适合练度成型之后逐步清完。
部分限时活动也会附带专属挑战任务，这类任务不会出现在常驻挑战标签，一般在大厅右上角的活动图标内进入，活动结束之后就会关闭入口，玩家需要留意活动界面的任务列表，避免错过限定奖励。如果找不到挑战标签，大多是主线推进不足或者管理员等级未达标，优先推进主线剧情，提升管理员等级之后，前往作战内的挑战板块就会正常显示全部内容，已经解锁却看不到部分副本，可以横向滑动挑战页面，很多副本卡片隐藏在页面右侧区域，滑动之后才会显示完整。
挑战任务的收益和选择的难度直接挂钩，新手不要盲目冲击最高难度，优先选择能够稳定通关的档位拿满基础奖励，随着刻印、角色跃迁养成逐步完善，再慢慢向上挑战更高层级。周期性挑战副本尽量按时完成，跃迁材料、刻印兑换货币只有挑战副本能够稳定产出，长期积累下来可以大幅加快全队的养成进度，主线关卡的挑战模式属于额外补充奖励，不用强求立刻全部完成，角色练度提升之后回头补做即可。
