防守目标要先看玩法：日常发育优先保护正在积累的资源，冲杯或排位优先保护大本营和关键防御，部落对战则优先防止对手拿到大本营星与满摧毁三星。排位防守最多影响40个奖杯，进攻方拿不到的部分会转给防守方；部落对战单个基地最多产生3颗星，分别与50%摧毁率、大本营和100%摧毁率相关，因此战争阵型不能只保护资源仓库。
低本和资源紧张阶段应先防守资源仓库、部落城堡和主要输出建筑，中高本则应把大本营、核心范围伤害、防空设施与英雄巡逻区域放进多层火力交叉区。资源阵型可将仓库分散到2—4个区域，避免一次法术或一条进攻路线同时清空；大本营不要贴在外围，也不要与所有高价值防御挤在同一小格内。经常被地面部队突破时，优先补强范围伤害、地面陷阱和城墙分区；经常被空军两星或三星时，应把防空设施错开布置，并让空气防御覆盖大本营和资源核心。
部落对战最该防守的是“稳定两星”和“低成本三星”，而不是仓库里的金币、圣水或暗黑重油。战争基地中资源仓库、采集器可以放在进攻路线外侧充当延迟目标，用建筑血量拖慢敌军，让核心防御获得更多输出时间；部落城堡尽量居中，防止敌军用少量单位提前引出援军。阵型编辑完成后，应从四个方向检查：是否存在不用破墙就能直达大本营的路线，是否能用一组法术同时覆盖多个核心防御，外围建筑是否会送出过多百分比，以及空军是否能沿同一侧连续拆掉防空。
防守调整应以最近5—10场防守记录为依据，每次只改动一个区域并观察结果。若敌人常从同一侧下兵，可把高伤害陷阱放在该侧的必经格，把单体防御负责处理英雄和重型单位，范围防御负责清理成群部队；若问题是大本营被快速拿走，应先调整大本营与城堡位置，而不是单纯升级外围建筑。刚升级大本营的玩家先保证新增防御全部建成并形成覆盖，中期玩家重点补齐防空、范围伤害和陷阱，高本玩家则应按部落战对手的主流流派调整分区、诱导路线和核心防御间距。防守的合格标准不是完全不被摧毁，而是让对手必须投入更多兵力、法术和时间，才能从一星推进到两星或三星。
